10月30日作《关于现在紧急动员中河北军区的建设工作》的报告，正确地阐明了军区在战争中的地位、作用，指出它既是蓄积武力的机关，又是使用武力的机关。
11月26日与邓小平向八路军总部发出《为确保太行山阵地我军部署的报告》，提出准备应付国民党顽固派的进攻。
12月阎锡山制造“十二月事变”，采用阴谋手段分化瓦解由共产党创建和掌握的山西抗战决死纵队中的部分队伍。
12月18日至25日指挥部队进行了邯（郸）长（治）战役，歼日伪军760余人，收复邯长公路沿线多处重要城镇，改变了太行根据地受敌顽夹击的不利局势。
1940年48岁
1月1日参加师直属队元旦团拜会，并讲了话。1月18日向各部队发出《第一二九师关于磨擦情况及我各部队加强戒备的指示》，指出主要打击对象应指向日军，但对国民党顽固派也必须提高警惕，以免陷入前门拒虎、后门进狼的危险境地。
l月19日陈赓率第三八六旅主力进入太岳区，统一指挥该区八路军、决死队，反击蒋阎军的进攻。
1月下旬赴冀西与国民党军政头目第九十七军军长朱怀冰、新二十四师师长张东凯、冀察游击第二纵队司令夏维礼和鹿钟麟等谈判，争取他们团结抗战，不与八路军搞磨擦。
本月与邓小平向部队发出《第一二九师对顽斗争方针》。指出对国民党顽固派应区别不同对象不同表现，采取打击、孤立、团结、争取的不同方针。
2月2日发出《第一二九师关于冀南反顽战役基本命令》。指示部队集中力量消灭磨擦最力的国民党军第三十九集团军石友三部，作战方法是各个消灭石军突出部队和薄弱环节，特别要注意创造运动歼敌的条件。
2月9日至18日冀南军区部队和冀中警备旅、晋察冀挺进支队等进行了冀南反顽战役，歼灭顽军石友三部2800余人。
2月12日到师轮训队上军事课，讲战斗组织和游击战术问题。
2月13日给师轮训队上政治课，讲解《联共党史》的结束语。2月25日制定《磁（县）武（安）涉（县）林（县）地域作战计划》。预计消灭侵入太行根据地腹地的国民党顽固派朱怀冰部。
3月4日至11日冀南军区部队和冀中警备旅等进行了卫（河）东战役；毙伤顽军石友三等部3600余人。
3月5日至8日邓小平率第一二九师等部队进行了磁武涉林战役，歼灭顽军朱怀冰部等万余人，恢复了被侵占的根据地。
4月在黎城出席中共中央北方局高于会议。会议提出了建党建军建政的任务。在会上作《党军建设问题》的报告，提出了军队建设各个方面的指导原则，特别是提出了“敌进我进”的作战方针。
5月5日至8日与邓小平指挥太行、太岳军区部队进行了白（圭）晋（城）战役，歼日军350余人，彻底破坏白晋铁路北段的路轨、桥梁等，挫败了日军用交通线和据点分割、控制根据地的“囚宠政策”。
6月根据北方局黎城会议决定的建军方针，对所属部队进行了整编，统一编成11个旅、34个团。
8月1日冀南、太行、太岳行政联合办事处（简称冀太联办）在涉县东辽城成立。
8月16日向部队发出《第一二九师关于正太战役的作战命令》。
8月20日至9月10日指挥部队进行了破击正太路战役（又称百团大战）第一阶段作战。协同晋察冀军区部队破毁正太铁路三分之二以上，攻占沿线大部分据点。
9月20日写出《第一二九师百团大战第一阶段战役总结》。
9月23日至30日指挥部队进行了百团大战第二阶段榆（社）辽（县）战役，攻占榆辽公路大部分据点，粉碎了日军利用榆辽公路深入“扫荡”，蚕食晋冀豫根据地的阴谋。
10月3日对新华社记者发表关于百团大战的谈话，盛赞百团大战对推进全国特别是华北抗战的作用及取得的巨大战果。
10月6日至11月15日指挥部队进行了百团大战第三阶段反“扫荡”作战。其中在关家垴歼灭日军一个大队中的400余人。
第一二九师所属部队在百团大战中共歼日伪军8000余人，破坏根据地内外的铁路、公路共500余公里，攻克和收复城镇据点共60余座，取得了巨大的战果。
12月写出《我们怎样从1940年向1941年迈进》的报告，全面、系统地总结了1940年第一二九师及晋冀豫军区的作战与建设情况。
1941年49岁
1月26日参加太行军区召开的武装干部会议，主持制订了民兵发展计划和民兵职责条例。
l月31日致电中共中央，请缨南下援助在皖南事变中遭受严重损失的新四军。
l月开办第一二九师第一期参谋训练班。
2月1日在太行军区扩大会上作《关于太行军区的建设与作战问题》的报告。
4月15日发布《第一二九师、太行军区联合命令——对军分区建立野战军队管区的指示》，规定太行军区所属5个军分区分别隶属于师和各旅管辖。
5月19日电令太行军区，为配合晋南国民党友军作战，向洪洞南北侧同蒲铁路进行破击。
5月24日发出《第一二九师关于强化游击集团的命令》，要求各级健全、强化地方武装与人民武装相结合的游击集团，对敌展开全面全力的斗争。
6月4日与邓小平发出《第一二九师关于乘机开展晋南太岳中条山局面的指示》。指示太岳军区乘国民党军队被日军逐出中条山的有利时机，迅速派部队进入其间开辟新的抗日根据地。
6月30日发布《第一二九师关于游击集团的训令》，明确规定了游击集团的组成、作用与指挥系统等问题。
7月7日晋冀鲁豫边区政府成立。原冀太联办的辖区增加了鲁西33个县。
8月31日至9月2日指挥部队进行邢（台）沙（河）永（年）战役，攻克敌据点、碉堡60余座，歼日伪军1300余人。挫败了敌人利用平汉铁路阻隔太行根据地与冀南根据地的计划，打通了山地与平原的联系。
9月18日第一二九师举行全师运动大会，检阅了4个月整军的成效。
10月31日向部队发出《策一二九师反对敌人大“扫荡”的战术指示》，针对日军强化政治、经济、军事、文化等“总力战”和采取铁壁合围、辗转电击、捕捉奇袭等新战术，指示各部队结合民兵和人民群众，发挥游击集团的作用，粉碎日军发动的秋季大“扫荡”。
10月31日至11月20日指挥部队进行了秋季反“扫荡”作战，共歼敌1300余人。
12月写出《第一二九师关于1941年的军事工作总结报告》，总结了全年的战况和作战、队务、训练、管理等方面的经验，提出了新的一年的工作方针。
1942年50岁
1月3日颁发《1942年军事工作实施纲要》，规定了部队军事工作诸方面的工作任务。
1月15日与邓小平颁发《第一二九师关于实施精兵建设的命令》，要求部队必须坚决贯彻中共中央关于精兵简政的指示，并规定了各部队精简兵员的任务与办法。
2月3日至3月3日指挥太行根据地军民进行了春季反“扫荡”，歼日伪军3000余人，迫敌比原计划提前一个月结束“扫荡”。
3月17日发布《关于武装工作队初次到敌占区工作的指示》，提出了相应的政策要求和战术原则。
3月25日发出《第一二九师、太行军区关于武装工作队的组织及任务的指示》。
4月写出《总结太行军区二月反“扫荡”的军事经验教训》，分析了敌军“扫荡”的规律和战术特点，有针对性地提出了抗日军民反“扫荡”的主要战斗动作。
5月12日发出《第一二九师关于准备反“扫荡”的命令》，指示太行军民积极行动起来，粉碎日军的夏季“扫荡”。
6月9日至20日指挥太行军民进行了夏季反“扫荡”。率领师指挥所和直属队突出敌人合围圈。
7月27日在师政治部驻地王堡作《武工队在敌后活动的战术问题》的报告。
8月1日写出苏军《合同战术》译版序言，指出学习苏军战术必须以八路军自己的战术为核心。
8月19日在《新华日报》（华北版）上发表《怎样把政治攻势变为物质力量》的谈话，就开展对敌政治攻势的意义、效果和方法。作了简明的解释。
本月作《太行军区1942年夏季反“扫荡”的军事总结》。针对日军“扫荡”抗日根据地所采取的新的方针和战术，总结出了以主力实施圈外突出和小部队圈内坚持相结合等一整套反敌合围的战术原则。
9月2日在太行军区各分区参谋长会议上，作《关于配合晋察冀反“扫荡”与太行反“扫荡”的准备问题》的报告，提出军事打击与政治攻势、反蚕食与反“扫荡”、基干军队与游击集团等相互配合等反“扫荡”要旨。
10月10日在武装干部测验会上发表训间。就民兵的组织、职责、任务与战术提出了指导性的意见。
12月16日太行军民隆重集会庆贺刘伯承师长五十寿辰。朱德、叶剑英、陈毅等发来了贺词、贺诗，邓小平等发表了贺文。
1943年51岁
1月17日发出《第一二九师关于1943年生产、工作计划的训令》。
1月25日至2月20日在涉县温村出席太行分局召开的高干会议。会议讨论通过了邓小平所作的《五年来对敌斗争的概略总结与今后对敌斗争的方针》等报告。
1月30日颁发《第一二九师1943年营兵（包括正规军、游击队）训练工作纲要》。
3月5日与邓小平等发出《太行分局、第一二九帅关于加强人民武装工作的指示》。
3月25日参加晋冀鲁豫边区政府召开的日军士兵代表大会暨日本反战同盟大会。在会上讲话，赞扬日本反战同盟和反战士兵所取得的巨大反战成绩，鼓励他们展开进一步的反战活动。
4月12日与左权合泽的《苏军步兵战斗条令》第一部出版，写了�