到此言大喜，忙让人准备传位之事。玄都大法师传讯完毕后便回大赤天去了。
伏羲将烈山氏召来说道：“我不日就要退位到火云洞静修，这些年你做事我都看在眼中，人族之中你是最有才华的一个，我准备将人皇之位传于你，你去准备一下吧。”说完便让烈山氏去准备接位之事。数日之后，玄都大法师再次来到陈地，对伏羲说道：“快摆香案，老师要来了。”伏羲忙让人摆好香案准备迎接圣人。
不一会天上降下瑞气千条，飘来一朵紫云，太清圣人太上老君骑着兕牛由金角童子牵着绳驾云而来。众人忙跪拜迎接圣人，伏羲带头说道：“弟子伏羲率人族各头领参见太清圣人。”老子说道：“不必多礼，起来吧。”
众人起身后便在太清圣人的主持下见证了伏羲与烈山氏皇位交接的仪式。就见在伏羲将皇位传给烈山氏的时候，天上降下霞光照在伏羲身上，须臾霞光散去，伏羲对太上老君说道：“劳烦师兄前来接我。”
原来就在天降功德加身的时候，伏羲便已恢复了前世的记忆，而且证得天皇之位。伏羲转身对烈山说道：“皇弟，为兄在火云洞等你。”说完便向王屋山方向一拜，接着跟着老子向火云洞行去。伏羲证得天皇之位时，王屋山再次降下一份功德，清虚将其收取暗忖道：“伏羲已然证得天皇之位，现在神农应该已经接位了，该准备去收他为徒了。”
却说烈山氏在接任伏羲成为人皇之后，便开始在整个人族推广耕作之术，人族因其教授众人耕作之术便将其尊称为“神农”，又因烈山氏烧山为田有火德，故也被称为“炎帝”。
神农氏教民种五谷后，并不单单靠天而收，还教民打井汲水，对农作物进行灌溉。同时，他还发明了陶器，解决了人类的生活用具——器皿和陶盆、陶罐等。
农业的出现，人类的劳动果实已有剩余，这时，神农氏设立集市，让大家把吃不完，用不了的食物和东西，每天中午拿到集市上去交换，从而出现了原始的商品交易。还治麻为布，使民着衣裳。更削木为弓，以威天下。
神农之教曰：“丈夫丁壮而不耕，天下有受其饥者，妇人当年而不织天下有受其寒者，故身自耕妻亲蚕以为天下先。”神农管理部落，治理天下很有方法。他不望其报，不贪天下之财，而天下共富之。智贵于人，天下共尊之。他以德以义，不赏而民勤，不罚而邪正，不忿争而财足，无制令而民从，威厉而不杀，法省而不烦，人民无不敬戴。
此时人们不知山林中的植物并不是所有的都能吃，而有些是有毒的，人民常有被毒死的，神农不忍便立誓走遍天下，尝遍百草、使人们知道什么能吃，什么不能吃，那些吃了有害，而那些吃了有益，神农下定决心后便离开部落在洪荒各地游荡，以图尝遍百草。
如此数年时间神农找出了许多可以食用的植物，也多次中毒，最多的时候曾一日中了七十次毒，虽然每次都靠着自己强健的身体和丰富的药草知识挺了过去，但是毒物已然将他的身体弄跨，而且毒素也潜伏在了他的身体里面，已经无法在经受毒药的侵袭。
这一日神农在采药之时不小心被毒蛇所咬伤，本来以他的身体是可以将毒抗住的，但是没想到蛇毒又将潜伏在他体内的毒素引了出来，数毒并发神农却是扛不住了，神农只觉的肚中如翻江倒海一般，肠胃好像纠缠在一起，火烧一般的疼，就在这时神农还在考虑族人的问题“我快要死了吗？我不甘心啊！还有好多东西能不能吃、有没有毒还未测出，治疗蛇毒的东西也还未曾找到，族人若是被蛇咬到可如何是好？”
慢慢的他的意识开始模糊，就在这时神农看见一位道人驾祥云而来，落在自己身前，喂自己吃了一丸仙丹，过了一会他觉得自己好了，不但体内以前留下来的毒全部消失了，而且身体比以前似乎更好了。这道人正是清虚道君，此时清虚心中正在想“我悄悄跟了他这么多年一直无事，这次见他开始尝百草便回王屋山用乙木之英为他炼制一把神鞭，不料就在这段时间他就出事了，幸好算出他有难赶快赶来了。”
神农起身后整理好衣冠对清虚一拜说道：“多谢仙长就我性命，不知仙长在何方洞府修炼，弟子日后必登门感谢。”清虚将神农扶起道：“贫道乃九华山清虚道人。”神农闻言一惊，说道：“原来是天皇帝师。”清虚问道：“你欲往何处而去啊？”神农说道：“小皇见族民不时误食毒草，便欲遍尝洪荒百草，使族人知道何物可食，何物不可食。今日遭此一难，知道了世间有毒之物不仅仅是草木，还有动物，而且也知道了中毒的感觉，现在我不仅要遍尝百草让族民知道什么可食，还要找出治疗各种毒物的方法。”
清虚此时心中恍然“天意如此，要让神农身受毒伤，使他产生找到治疗毒物的办法。”想到此处清虚便笑道：“你不过一凡人，一生能有多少岁月，况且这洪荒中有些毒物就连贫道都受不了，你又能尝出几许？”神农却是一脸坚毅的说道：“不管能辨别出多少毒物，能找到多少治疗毒伤的药草，我都会干下去，能找到一点就能使族民少受一点痛苦，我之生死早已置之度外。”
清虚想到“难怪能成为三皇之一，就这份为民不惜自身性命不怕中毒的痛苦的意念也是常人所没有的。”想到此清虚便开口说道：“贫道愿收你为徒，助你辨别百草，如何？”神农闻言大喜，立时便欲行拜师之礼，因为他知道自己有了神通之后可以毒死自己的东西就会更少，自己也就可以找出更多的毒物和治疗毒物的方法。
清虚将神农扶起说道：“此刻不急于拜师，你我还是先回部落，待你将部落诸事安排妥当之后在拜师随我修行。”说完便带着神农飞到陈地。
第二卷 人族当兴
第四章 清虚为徒求丹书
清虚驾起祥云将神农带到陈地之后便让神农将部族之事交给手下之人，便让神农白日随自己修炼上清大法，晚上则教授神农一些药理知识和治国之道，如此匆匆数十年时间眨眼而过，这一日清虚将前日方练好之神鞭交给神农道：“此乃为师用乙木之英所炼成的宝物，可辨识万千草木，只要用此鞭打过便可知这种植物有毒无毒，却是方便你辨别百草，但是此物只可辨别草木有毒无毒，却无法辨别出毒性之强烈，你要想知道毒性还得自己试验。但是，你要记住洪荒中有无数异物，有些就是为师也是不识，更加不敢尝试，你的道行虽然嶒长迅速但还是不要轻易去尝试一些看起来比较奇怪的物事。”神农却是开口说道：“若是能将世间所有有毒之物全部辨识出来，并找到能够治疗使族人能够不再受苦，我就是身死也是无憾了。”清虚闻言一愣不由想到“不愧是成为三皇之一的人，就这份心已然远超后世大乘佛教的四大菩萨了。”遂开口说道：“你既有此心，为师也不愿阻你，但还是万事小心，为师走了。“说完也不待神农挽留便走出木屋驾祥云而去，回九华山而去了。清虚回到九华山便开始炼制自己在共工怒撞不周山时所捡来的那些碎片，只听清虚说道：”花费数千年时间终于将所有的碎片炼成一体，现在就等神农证得地皇之位后将所有得到的功德加入其中便可以炼成了，虽然大小没翻天印大，但是有我指点女娲娘娘造人是所得的功德，有辅助女娲娘娘补天所分得的功德，再加上教授伏羲和神农所得的功德，有这四份功德加入其中想来应该不弱于他翻天印，过段时间便该去有熊部落找轩辕姬了，他应该快出生了吧，等轩辕证得人皇之位后我便以三皇帝师之名在洪荒人族传道。”
不说清虚在九华山炼制法宝，神农见老师驾云而去便召集各部落头领和官员询问这数十年人族之事，闻听人族并无什么大事，只是那些老弱族人偶尔遇上头痛、发烧之事发生时依然无法可想，有些族人就这样死掉了，甚至一些壮年男女发生这样的状况也就无法干活了，只能躺在床上等着好转，而且这些现象现在越来越多，再就是误食毒物或被毒虫、毒蛇所伤的族人越来越多，虽然有上次伏羲出去带回来毒物的记录，但是现在族人却是越来越多，需要的土地也越来越多，族人需要到山林中烧山为林，遇上很多未曾见过的草木。伏羲闻言一愣，“自己随老师修炼前虽也有这样的事发生可是却没有死人，现在怎么有族人死了？早知应该问一下老师。”转眼间神农又想到：“不能总是靠老师，我因该自己想办法解决此事。而且也该继续出去辨别草木的毒性了不然族人中毒的会越来越多，而且治疗毒虫毒蛇咬伤的东西也必须尽快找到。”神农却是不知，万事有一利则必有一弊，谷物虽然使族人得到了更多的食物，可是食用谷物之人却是身体不如食肉之人，故以前对族人基本无害的一些病痛现在却是可以要命。
神农听到这些事便坐不住了，将部落之事安排好之后便出门向大山深处行去，一路之上但凡见到以前未曾见过的草木便用清虚所炼制的神鞭赭鞭打一下，看其有毒无毒，并将他们记录下来，等到晚上的时候便将那些毒草服下，检验其毒性的强烈，慢慢的神农发现各种毒药都有都有五行属性，有些厉害的毒药更是混含了数种五行之力，所以才毒性剧烈，神农察其寒、温、平、热之性，辨其君、臣、佐、使之义，慢慢的便可以用之解毒，还可以治病。一天神农在石缝中找到一支开小黄花的藤状植物，神农用赭鞭打一下发现其中蕴含剧毒，便把花和茎吃到肚子里以后，没有多久，就感到肚子钻心地痛，好像肠子断裂了一样，连忙用功将毒性化解，一会神农起身擦了一下头上的汗说道：“幸好我有老师传下的道法护身，不然就会死在这里了，一定要将这种草记下来告诉族民，以免族民误食而丧命。这种草吃下去肚子钻心地痛，好像肠子断裂了一样，就叫”