定要将这种草记下来告诉族民，以免族民误食而丧命。这种草吃下去肚子钻心地痛，好像肠子断裂了一样，就叫”断肠草“吧。经过数十年的辩尝发现甘草可以治疗咳嗽，大黄可以治疗便秘，黄莲可以消肿等等。
经过数十年的辩尝，神农终于几乎将所有的草木都尝遍了，还写下了一本书《神农本草经》，《神农本草经》阐述了药物的三品分类及其性能意义，药物的君臣佐使及在方剂配伍中的地位和作用，药物的阴阳配合、七情合和、四气（寒热温凉）五味（辛甘酸苦咸）、有毒无毒，药物的采造，药物的煎煮法，药物与病证的关系等等。当这本书写完的时候天上降下功德落于神农身上，同时在九华山也有一团功德降下落于清虚身上。神农回到陈地便开始教授族人医药之术，神农又发现有些病发起来很快，等药煎好的时候病人已经快不行了，药服下去也不管用了。所以神农想能不能找到一种方法，将药物的精华全部存下来，在病人刚发病的时候便将其服下，病人便可以乘早将其服下便可以保住性命，神农想了很久，都没找到方法。突然有一天神农想起当年自己中蛇毒时老师给自己服下一丸丹药，治好了自己中的毒，不由想到：“仙丹是仙人将仙草仙果去其糟粕炼制而成的，那么人应该也可以将草药炼成丹药，可是l老师没有教我怎样炼制丹药。恩，老师的道场在九华山，我就去九华山找老师，向老师请教。“
想到此处神农便驾着云向九华山飞去，神农飞了数月时间才飞到九华山，而此时清虚正在大赤天太上老君处，原来清虚算出神农要到自己处求炼丹之术，可是自己对于丹术却是并不精通，一时颇为为难，后想起大师伯太上老君的炼丹之术乃是世上最好的，便赶到大赤天向太上老君求炼丹之术。刚到大赤天便见玄都大法师站在八景宫门口等候，见清虚到来忙上前说道：“师兄！老师命我在此等候多时了。“清虚也知圣人神通不同一般，自己刚出门大师伯恐怕就知道自己来的目的了吧。清虚随玄都大法师进入八景宫拜过老君后便坐于一旁等候也不说话。老子见清虚坐下便开口说道：“你的来意我知道，丹术我已替你准备好，还炼制了一炼丹的丹鼑，你一起拿下去吧。”说完便将一卷丹书和一支小鼎交给清虚，清虚拜谢道：“多谢师伯。”老子说道：“吾掌人教，神农也算我之弟子。”说完便闭目打坐去了。清虚见状便拜过后在玄都大法师的带领下出了八景宫向外行去，待出了玄都洞清虚对玄都大法师说道：“师弟不必相送，我去也，早就想和师弟一聚，可是你我皆是掌教大弟子，却是不得闲，以后定要找空和师弟一叙。”说完便驾云而去。玄都大法师看着清虚驾云远去之后便转身进了玄都洞八景宫。
第二卷 人族当兴
第五章 神农得传炼丹术
清虚离了大赤天一路直如风驰电掣般向王屋山飞去，俗话说山中方一日，世上已千年。在这圣人道场呆了一炷香的功夫，谁知道人间已然过了多长时间。就这样等清虚回到王屋山之时神农已然在上清观等了数月。
原来清虚在去大赤天之前便将神农相貌告知孔宣和白翎童子二人，让他们在神农来时将神农留在王屋山，他自己去去就来。不料这一去便是数月时间，神农忧心族民，若不是孔宣与白翎二人苦留，神农怕是已然回了陈地。
清虚进入上清观大殿便让白翎将神农焕来，神农闻听白翎言道老师已归，便急忙赶来。进入大殿见清虚端坐于蒲团之上便大礼参拜道：“弟子神农氏参见老师，老师万寿。”清虚虚空抬手将神农扶起说道：“你的来意我已知晓，但是为师并不精通于丹术。”
还未说完便见神农一脸的失望忙说道：“不过为师已然从太清境大赤天求得炼丹之术。当将此法传授于你。”神农闻言大喜忙准备拜领，却又听清虚说道：“不过此术乃圣人之法，不可轻传。”神农忙问道：“那要如何才能得传这圣人之法？”清虚笑言道：“此事说难也难，说易却也是极为容易。”
神农忙问道：“究竟是何法？”清虚道：“无它，只要一诚心尔。”说完便闭目入定去了，不在理会神农。神农苦思良久方一脸释然，出门驾云而去。
孔宣待神农离去之后便进殿问到：“老师，那丹术大老爷不是已然交给老师，让老师传于神农么？怎的老师又要为难于他？”清虚笑道：“痴儿，大师伯虽说将此书卷交与为师，让为师传于神农，但圣人之术又岂是可以轻易传人的？不让他经历一番怎显得此术之贵重，况且圣人虽为圣，却也为人。大师伯为人教教主，如此也可是众生知晓大师伯的恩德。”说完便再次闭目入定去了。孔宣闻言思索片刻后摇摇头离去。
却说神农自离开九华山便日夜不停的赶赴陈地，待到得陈地便召集众人说道：“我师欲传我炼丹之术，但此术为圣人所传，不可轻授，你等可随我沐浴斋戒，七天后随我同拜太清圣人，以求圣人传下丹术救我万民。”说完便让人开始修建祭坛，自己也在打坐片刻略恢复元气后便带领众人沐浴斋戒。
七天后，神农让人在祭坛上摆上混元无极太上人教教主太清圣人太上老君之灵位，灵位前供奉时令鲜果、猪牛羊三牲。神农率众族民拜祭道：“下界弟子人皇神农氏率天下万民叩首顿拜，洪荒万民不识草木丹石之术，病无所医，今弟子率万民在此顿拜，请圣人教主慈悲，传下丹术救我洪荒万民！”
神农生后众人皆拜道：“请圣人慈悲，救我洪荒万民。”可那灵位却是无有丝毫反应，神农想起老师曾言欲得此术须有诚心，便也不起身一直拜伏于地。众人一直这样从早跪到晚，又又由晚跪倒早，那灵位始终无有一丝反应，众人直跪了三天三夜，除却一些老弱无法持久晕倒之外，其他人皆一直跪于原地。
突然从三十三天外降下一道清光罩在灵位之上，进而将所有跪拜之人包于其中，众人只觉一股清凉之气从顶上灌下，不但这三天三夜跪拜的困乏一扫而空，而且多年的痼疾也是全部消失。
众人待清光散去后皆拜谢道：“多谢教主圣人！”清虚见天降祥兆便知大师伯已然同意此时将丹术传于神农便现出身形对刚刚起身的神农说道：“神农，吾奉圣人之命将此丹术传于你，望你用此丹术救治万民，不要辜负太清圣人传你丹术的心意。”说完便将那一卷丹书交给神农，又从袖中将太上老君所炼的丹鼑取出，说道：“此鼎可唤之‘神农鼎’，乃是太清圣人怕你炼丹没有好的炉鼎专门替你所炼。”说着便将神农鼎交给神农。
神农接过神农鼎后又再次拜谢太上老君赐鼎。清虚见此事已完便对神农说道：“你我以后要再见面却是不知在何时了，望你自己珍重，一切好自为之。”说完便驾祥云而去。神农感念太上老君赐下丹术、炉鼎以救万民，便在人族各部落建太清观，让百姓知道老君的恩德。又念清虚为两代帝师功劳卓着，便命人在陈地修建上清观主祀上请圣人通天教主，清虚道君陪祀，截教之名开始在人族之中传播。清虚却是成为道门二代弟子中第一个扬名洪荒的。
神农自得到丹书之后便在陈地苦苦钻研，以求早日学会炼制丹药之术，以便传于族人，早点解决困扰族人的病痛。这且不说。此时清虚已然来到轩辕丘，因为此时未来的人皇——公孙轩辕已然出生，清虚要赶在广成子前面收其为徒，以广大截教门户。
却说在轩辕丘有个人族部落叫——有熊，其部落首领叫少典，少典有两位夫人，其中一位叫附宝。有一天晚上，附宝见一道电光环绕着北斗枢星。随即，那颗枢星就掉落了下来，附宝由此感应而孕。怀胎24个月后，生下一个小儿，少典为之起名叫轩辕。
轩辕一生下来，就显得异常的神灵。生下没多久，便能说话，族人皆异之。这一日少典正在处理族中之事，突然有人来通报说是被称为两代帝师的仙人清虚道君前来，少典大惊，忙叫那人带路自己前去参拜，通报之人说道清虚道君已在自己家里，少典忙一路小跑跑到自己家中，刚进家门便见一身穿月白道袍，头戴紫金九宫冠的道人正坐于家中，怀中抱着自己的少子公孙轩辕。少典忙上前参拜。
清虚将其扶起道：“你就是有熊部落的少典？”少典答道：“在下正是。不知仙长驾临此地有何要事。”清虚笑道：“族长不必担心，贫道次来只因族长之子轩辕与贫道有师徒之缘，贫道欲带起上山修炼，不知族长意下如何？”少典闻言大喜想道“清虚仙长收两徒皆为人皇，难道我儿有人皇之命？就算不能为人皇，能得清虚仙长教诲也是天大的机缘啊。”想道此处便说道：“能得仙长收小儿为徒是小儿的福分，在下又怎能不答应。”
附宝闻言虽然不舍，但附宝也是聪慧之人，知能得清虚道君收为弟子日后必能成为一大才。清虚见少典夫妇已然同意便说道：“那贫道就将其带走了，十五年后贫道便会放其归来。”说完便驾祥云向王屋山飞去。
第二卷 人族当兴
第六章 王屋山轩辕下山
却说神农自得到丹书之后便开始研习，却不免冷落了家人，神农有个小女儿名叫女娃，最得神农喜爱，却也是非常懂事，他见父亲忙碌便也不去打扰，只和部落中的小孩一起玩耍，一日女娃出门玩耍，却看见一个大孩子把小孩子当马骑。小孩都累爬下了，大孩子还不肯罢休。
精卫走过去，指着大孩子的脑门怒斥道：你这个人太不知羞耻，欺负小孩子算什么本事，有力气，去打虎打熊，人们会说你是英雄。
大孩子见精卫是个小姑娘，生得单薄文弱，根本不把她放在眼里。他从小孩背上跳下来，走到精卫面前说：我是海龙王的太子，你是什么人？竟敢来管我！精卫说：龙王的儿子有什么了不起，我还是炎帝神农的女儿呢，以后你少到陆地上�